হেফাজত ইসলামের চার নেতাকে গ্রেপ্তার করা হয়েছে।  তারা হলেন ঢাকার ইসলামবাগ মাদ্রাসার শাইখুল হাদিস ও প্রিন্সিপাল, জমিয়ত মহাসচিব ও হেফাজতে ইসলামের কেন্দ্রীয় সহকারী মহাসচিব মাওলানা মঞ্জুরুল ইসলাম আফেন্দী, হেফাজতে ইসলামের সহকারী মহাসচিব মাওলানা সাখাওয়াত হোসেন, হেফাজতে ইসলামের কেন্দ্রীয় সাংগঠনিক সম্পাদক আজিজুল হক ইসলামাবাদী ও কেন্দ্রীয় কমিটির সহ-প্রচার সম্পাদক মুফতি শরিফউল্লাহ। এ ছাড়া সহ অর্থ সম্পাদক ইলিয়াস হামিদীকেও গ্রেপ্তার করা হয়েছে বলে জানা গেছে। 
এর মধ্যে গত ১৪ এপ্রিল বুধবার সন্ধ্যায় রাজধানী ঢাকার লালবাগ এলাকার একটি মাদ্রাসার কাছ থেকে গ্রেপ্তার করা হয় হেফাজত ইসলামের নেতা সাখাওয়াত হোসেনকে। সাখাওয়াত হোসেন কয়েকদিন আগে ঢাকা রিপোর্টার্স  ইউনিটিতে এক সংবাদ সম্মেলন করে হেফাজতের আরেক নেতা মমিনুল হকের দ্বিতীয় স্ত্রীসহ রিসোটে ধরা পড়ার  ঘটনায় মমিনুলের পক্ষে প্রতিবাদ জানিয়েছিলেন।
পুলিশ জানায়, গতকাল বুধবার সন্ধ্যার পর লালবাগ এলাকার একটি মাদ্রাসার কাছ থেকে সাখাওয়াত হোসেনকে গ্রেপ্তার করা হয় ।  সম্প্রতি  মতিঝিল, পল্টন এলাকায় নাশকতার ঘটনায় তার সম্পৃক্ততা পাওয়ার পর পুলিশ তাকে খুঁজছিল। সাখাওয়াতকে বৃহস্পতিবার আদালতে পাঠিয়ে জিজ্ঞাসাবাদের জন্য হেফাজতে পাওয়ার আবেদন করা হবে বলে গোয়েন্দা কর্মকর্তা মাহবুব জানান। গত মাসের শেষে ভারতের প্রধানমন্ত্রী নরেন্দ্র মোদীর বাংলাদেশে সফরের বিরুদ্ধে হেফাজতে বিক্ষোভ ও হরতালে বিভিন্ন স্থানে সহিংসতা ঘটে।
১৪ এপ্রিল বুধবার রাত ১১টায় রাজধানীর গ্রীন রোড এলাকা থেকে  মাওলঅনা মঞ্জুরুল ইসলাম আফেন্দীকে গ্রেপ্তার করা হয়। ২০১৩ সালের ৫ মে মতিঝিলের শাপলা চত্বরে হেফাজতের তান্ডবের ঘটনায় পুলিশের করা মামলায় তাঁকে গ্রেপ্তার করা হয়েছে। গোয়েন্দা পুলিশের মতিঝিল বিভাগের উপকমিশনার মো. আসাদুজ্জামান জানান, মঞ্জুরুল ইসলাম আফেন্দিকে আদালতে সোপর্দ করে জিজ্ঞাসাবাদের জন্য ১০ দিনের রিমান্ড চাওয়া হয়েছিল। আদালত পাঁচ দিনের রিমান্ড মঞ্জুর করেছেন।
গত ১৩ এপ্রিল মঙ্গলবার রাতে রাজধানীর যাত্রাবাড়ী থানার মীর হাজিরবাগ এলাকা থেকে মুফতি শরিফুল্লঅহকে গ্রেপ্তার করা হয়। আজ বৃহস্পতিবার তাকে এক দিনের রিমা-ে পেয়েছে পুলিশ। 
হেফাজতে ইসলামের কেন্দ্রীয় সাংগঠনিক সম্পাদক আজিজুল হক ইসলামাবাদীকে গত ১১ এপ্রিল গ্রেপ্তার করা হয। আজিজুল হক ইসলামাবাদী শীর্ষনেতাদের এক বৈঠকে যোগ দিতে চট্টগ্রাম গিয়েছিলেন।
হেফাজত আমির জুনাইদ বাবুনগরী সংগঠনের গ্রেপ্তার নেতা-কর্মীদের মুক্তি দাবি করেছেন।
কেন গ্রেপ্তার : পুলিশ জানায়, স্বাধীনতার ৫০ বছর পূর্তি ও মুজিব শতবর্ষ উপলক্ষে ভারতের প্রধানমন্ত্রী নরেন্দ্র মোদির দেশে আসা নিয়ে রাজধানীসহ সারা দেশের বিভিন্ন এলাকায় ব্যাপক তা-ব চালায় হেফাজতে ইসলাম। সম্প্রতি হেফাজতর কেন্দ্রীয় যুগ্ম মহাসচিব মাওলানা মামুনুল হকের রিসোর্টকাণ্ডের পর একে একে হেফাজতে ইসলামের নেতাকর্মীদের  গ্রেপ্তার অভিযান শুরু করেছে আইন-শৃঙ্খলা বাহিনীর সদস্যরা। এরই ধারাবাহিকতায় গত সোমবার চট্টগ্রাম থেকে হেফাজতের আরেক শীর্ষ নেতা আজিজুল হক ইসলামাবাদীকে গ্রেপ্তার করে র‌্যাব ও গোয়েন্দা পুলিশের যৌথ একটি দল। তাকে বর্তমানে ৭ দিনের রিমান্ডে নিয়ে জিজ্ঞাসাবাদ করা হচ্ছে। এছাড়া এরই মধ্যে সংগঠনটির আরো অনেক নেতা গ্রেপ্তার হয়েছে বলে সংশ্লিষ্ট সূত্র জানিয়েছে। হেফাজতে ইসলামের কেন্দ্রীয় সাংগঠনিক সম্পাদক আজিজুল হক ইসলামাবাদীকে গ্রেপ্তারের পর জিজ্ঞাসাবাদের জন্য হেফাজতে নিয়েছে পুলিশ। হেফাজতের হরতাল ও বিক্ষোভ থেকে নাশকতার সাম্প্রতিক ঘটনার পর এই প্রথম সংগঠনটির শীর্ষ পর্যায়ের কোনো নেতা গ্রেপ্তার হলেন।
সংশ্লিষ্ট পুলিশ কমকতারা জানান, ২০১৩ সালে মতিঝিলে হেফাজতের অগ্নিসংযোগ ও হত্যাকাণ্ডের ঘটনায় পল্টন ও মতিঝিল থানায় অনেকগুলো মামলা হয়েছে। আজিজুল হক ইসলামাবাদী অন্তত চারটি মামলার আসামি।